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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Convert2RGWAS. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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2.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Especificação formal por traços, composição de componentes e protótipos de ferramentas. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1993. 90 p.

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3.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Entendendo e interpretando os parâmetros utilizados por BLAST. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2001. 12 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Instruções técnicas, 6).

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4.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Um estudo preliminar dos requisitos para construção de um software DRIS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2000. 15 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 1).

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5.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Introdução a especificação formal de módulos de software por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1993. 16 p.

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6.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. MicroarrayCluster. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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7.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Predição de regiões de interface proteína-proteína baseada em informações estruturais. 2009. 134 p. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica. Área de concentração Engenharia de Computação) - Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas.

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8.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Uso de prolog para executar especificações formais por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1997. 19 p. (EMBRAPA-CNPTIA. Relatório Técnico, 1).

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9.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Uso do Prolog para executar especificações formais por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1997. 19 p. (EMBRAPA-CNPTIA. Relatório Técnico, 1).

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10.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Tutorial: introdução ao software brblup. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2020. 41 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 168).

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11.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Upload/GenBank/Chado. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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12.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. snpQC. versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

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13.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. snpQC. Versão 2.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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14.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Solvat. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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15.Imagem marcado/desmarcadoPIETROBON, T.; HIGA, R. H. Disponibilização de análise de controle de qualidade em GWAS e seleção de SNPs para exclusão de paternidade na plataforma Galaxy. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 9., 2013, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 23-24.

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16.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de. Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos (BDGF) para suporte a estudos de associação genômica ampla e seleção genômica em programas de melhoramento animal. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2015. 30 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 133).

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17.Imagem marcado/desmarcadoDIAS, V. F.; HIGA, R. H. Banco de dados de genótipos da Rede genômica animal. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 9., 2013, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 55-57.

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18.Imagem marcado/desmarcadoSOARES, A. R.; HIGA, R. H. Avaliação de ferramentas para detecção de interações epistáticas para fenótipos quantitativos em estudos de associação genômica ampla. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 105-107.

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19.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformática aplicada à agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 4. p. 67-83.

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20.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformatics applied to agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 4, p. 67-86.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  07/01/2010
Data da última atualização:  22/04/2010
Autoria:  HIGA, R. H.
Afiliação:  ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA.
Título:  Predição de regiões de interface proteína-proteína baseada em informações estruturais.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  2009.
Páginas:  134 p.
Idioma:  Português
Notas:  Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica. Área de concentração Engenharia de Computação) - Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas.
Conteúdo:  Este trabalho aborda o problema de predição de regiões de interface proteína-proteína, baseado em medidas de propriedades físico-químicas e estruturais. A abordagem considera os aminoácidos da superfície da proteína como unidades básicas para classificação, o que elimina a restrição de uso de patches, considerada por preditores do mesmo tipo. Este preditor é complementado por um segundo preditor, que identifica, dentre os aminoácidos da interface, os mais relevantes do ponto de vista de energia de ligação proteína-proteína, conhecidos como hot spots. A abordagem apresentada permite a utilização dos classificadores de forma independente na predição dos aminoácidos de interface e de hot spots. Diferente de outras abordagens encontradas na literatura para predição de hot spots, que a predição de hot spots seja realizada em complemento à predição dos aminoácidos da interface. O desempenho alcançado pelo preditor na identificação de hot spots é superior ao obtido por outros preditores descritos na literatura e que utilizam o mesmo conjunto de dados e critério de avaliação de desempenho.
Palavras-Chave:  Pattern recognition; Previsão; Protein; Reconhecimento de padrões.
Thesagro:  Proteína.
Thesaurus NAL:  Prediction.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
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Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA14419 - 1UPCTS - PP2010.00002
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